孔氏南宗家庙位于衢州市柯城区府山街道新桥街中段北侧，为中国仅有的两座孔氏家庙之一，素称“南宗”，该庙占地面积14000平方米，建筑面积7490平方米。距今约有700多年的历史。

衢州孔氏南宗家庙有中、西、东三条轴线：中轴线有大成殿，祭祀孔子。西轴线有六代公爵祠、袭封祠、五支祠，以祭祀孔氏历代先祖;思鲁阁供奉孔子夫妇楷木像、先圣遗像。东轴线有五王祠、恩官祠，祭祀孔子之五世祖及有功于衢州孔氏的历代官员。家庙西侧是嫡长孙居住的孔府及后花园。

孔氏南宗家庙由庙门、大成门、佾台、大成殿、东西两庑、圣泽楼、思鲁阁、六代公爵祠、袭封祠和五支祠组成。大成殿中和大成殿前，分别挂着康熙皇帝题写的匾额“万世师表”和雍正皇帝书写的匾额“生民未有”。大成殿正中有孔子塑像，两侧是伯鱼、子思塑像;殿内柱子上挂着雍正和乾隆写的两副楹联，分别是“德冠生民溯地辟天开咸尊首出，道隆群圣统金声玉振共仰大成”、“气备四时与天地鬼神日月合其德，教垂万世继尧舜禹汤文武作之师”。

孔氏南宗家庙既是官庙，亦有家庙功能，是衍圣公南迁后祭祀孔子先圣的地方，且比拟曲阜而建，具有重要的历史地位和极高的文物价值。当然因南渡后，特别是让爵后，地位下降，更没有如山东曲阜那般显赫，但它仍然发挥着两方面的作用：一是祭祀先圣，二是育人。

1996年，孔氏南宗家庙被国务院公布为第四批全国重点文物保护单位;2006年，孔氏南宗家庙被命名为“浙江省廉政文化教育基地”。